179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3259 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  81.99 
 
 		 162 aa  260  6.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  77.22 
 
 		 162 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  77.5 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  73.75 
 
 		 162 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  71.88 
 
 		 169 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  72.33 
 
 		 173 aa  228  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  51.37 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  49.66 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  49.66 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 175 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 146 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  46.62 
 
 		 132 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 179 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  36.09 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  36.2 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  36.96 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  31.86 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 132 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 400 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 134 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  32.22 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 361 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 147 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 138 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  45.61 
 
 		 269 aa  44.7  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 230 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 167 aa  44.3  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  29.37 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  38.16 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  30.17 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.55 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  32.94 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 315 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  27.52 
 
 		 524 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.83 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  27.62 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  39.47 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>