120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2655 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  100 
 
 
161 aa  328  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
175 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.71 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  36.97 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 
174 aa  60.8  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
193 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  36.51 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
173 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  33.58 
 
 
148 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
158 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  28.06 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  28.06 
 
 
151 aa  51.6  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3520  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  27.82 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.89 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  30.58 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  30.37 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
171 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 
154 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
164 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
147 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  46 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  31.68 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  30.58 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  27.82 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  29.63 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.38 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
282 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  34.29 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.04 
 
 
345 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.07 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  44.3  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  26.32 
 
 
154 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  44.83 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
346 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  26.92 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  30.56 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.93 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  46.97 
 
 
224 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  25 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
183 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
183 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.23 
 
 
345 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  28.83 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 
153 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
136 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
130 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
155 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  29.77 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
298 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  36.67 
 
 
163 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5882  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
191 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
151 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0230  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>