More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0620 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  45.7 
 
 		 175 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 169 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  38.31 
 
 		 156 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 175 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  42.52 
 
 		 157 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 169 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  43.88 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  37.42 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 157 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 161 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24720  hypothetical protein  42.99 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2924  hypothetical protein  48.28 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.018663  normal  0.0109649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1541  hypothetical protein  55.38 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.337603  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  40.74 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5117  hypothetical protein  41.67 
 
 		 122 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374179  normal  0.0675827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 146 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  36.21 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.85 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.29 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  31.16 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.91 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 199 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 165 aa  53.9  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 120 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 132 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  44.93 
 
 		 132 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  32.09 
 
 		 169 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 195 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 153 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 154 aa  52.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 154 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  41.18 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  41.18 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 157 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  41.18 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 141 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 153 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  30.26 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  30.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  30.26 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  30.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  30.26 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 151 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  31.86 
 
 		 153 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  36.25 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  38.04 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 169 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 146 aa  50.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  29.46 
 
 		 143 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 163 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 153 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 		 169 aa  49.7  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.71 
 
 		 352 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.04 
 
 		 147 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.04 
 
 		 147 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  47.17 
 
 		 524 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.43 
 
 		 154 aa  49.3  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.04 
 
 		 147 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 144 aa  49.3  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 166 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 205 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  39.71 
 
 		 154 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 154 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 157 aa  48.9  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  27.83 
 
 		 204 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  31.34 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.48 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  39.71 
 
 		 154 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  41.51 
 
 		 136 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  39.71 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>