215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1141 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  100 
 
 
165 aa  315  2e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  40.6 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 
163 aa  63.9  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
253 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  34.56 
 
 
175 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  44.55 
 
 
218 aa  58.2  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  38 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.05 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
149 aa  54.3  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
282 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
157 aa  53.9  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.88 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  34.44 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  40 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  40 
 
 
150 aa  47.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
303 aa  47.4  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
166 aa  47  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
303 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
229 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  34.88 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  47.69 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  39.76 
 
 
168 aa  45.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  45 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  38.24 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
154 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  43.33 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  54.24 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  48 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  48 
 
 
164 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  35.71 
 
 
157 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  62.16 
 
 
168 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  32.89 
 
 
156 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 
229 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
229 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.1 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  56.1 
 
 
148 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.86 
 
 
136 aa  44.3  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
135 aa  44.3  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
142 aa  44.7  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
147 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 
320 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  43.1 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  61.76 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>