More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0808 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  71.79 
 
 
159 aa  207  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  55.56 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  57.48 
 
 
398 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  49.62 
 
 
399 aa  116  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  46.56 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  52.34 
 
 
134 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  45.31 
 
 
152 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
129 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  45.53 
 
 
136 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 
139 aa  92  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  40.65 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  43.08 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  42.74 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  40.38 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  40.38 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  36.52 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  40.2 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  38.17 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  36.56 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
170 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  33.66 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  44.78 
 
 
158 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  29 
 
 
136 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.85 
 
 
128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02760  conserved hypothetical protein  32.46 
 
 
248 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  42.03 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
167 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  43.28 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  43.28 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1070  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000247956  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  30.3 
 
 
141 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3755  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  30 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1522  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467089  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.34 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3251  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000109349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1522  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  36.61 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  40.58 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  40.58 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  40.58 
 
 
160 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  40.58 
 
 
157 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
153 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1613  NUDIX family hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  36.67 
 
 
164 aa  47  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2850  NUDIX family hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.482932 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  32.2 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1721  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2023  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296194  normal  0.0882034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>