More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1092 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  266  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  85.4 
 
 		 137 aa  233  8e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  86.13 
 
 		 137 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  85.4 
 
 		 137 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  68.99 
 
 		 136 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  64.66 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  68.22 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  51.11 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  51.2 
 
 		 152 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  47.24 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  49.64 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  45.11 
 
 		 399 aa  98.6  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 398 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  55.04 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 139 aa  90.1  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  50.94 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  50.94 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  39.46 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  42.97 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  48.62 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  43.86 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  45.3 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  42.35 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  38.32 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.97 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.52 
 
 		 347 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 179 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  45.45 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  32.2 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  35.64 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.53 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  32.84 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  36.61 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  30.6 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  33.09 
 
 		 325 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  32.09 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  34.27 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  34.27 
 
 		 329 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  34.43 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  33.03 
 
 		 314 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.58 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  32.39 
 
 		 314 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 138 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2061  MutT/nudix family protein  36 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000668178  normal  0.862843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 134 aa  50.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  33.33 
 
 		 315 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  28.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.56 
 
 		 137 aa  50.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  27.78 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  28.8 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  30.83 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>