More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1062 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 137 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  99.27 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  94.16 
 
 		 137 aa  254  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  85.4 
 
 		 137 aa  231  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  70.45 
 
 		 136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  68.66 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  68.22 
 
 		 136 aa  169  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 141 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  51.11 
 
 		 152 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  53.6 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  51.2 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  47.73 
 
 		 399 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 134 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 398 aa  97.8  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  51.89 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  51.89 
 
 		 129 aa  94  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  46.73 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  49.54 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.75 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  36.22 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  42.15 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  41.53 
 
 		 354 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  38.53 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.8 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  35.11 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  33.8 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  33.82 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.67 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.81 
 
 		 347 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  31.01 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  37.5 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  32.14 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  32.14 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  30.47 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  31.15 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  30.83 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  31.15 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  31.15 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  31.15 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  31.15 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0076  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000742195  normal  0.603343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0575  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  31.15 
 
 		 334 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 299 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  31.45 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  32.31 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  31.71 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  29.75 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  25.36 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  25.36 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  27.66 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  30.97 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>