More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2672 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  100 
 
 
158 aa  319  9.999999999999999e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  79.62 
 
 
159 aa  265  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0608  NUDIX hydrolase  61.18 
 
 
166 aa  183  9e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.108383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
137 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 
171 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1210  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  44.44 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2537  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
150 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  49.23 
 
 
212 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
154 aa  54.7  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  55.17 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  47.54 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
301 aa  54.3  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1604  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
163 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00941783  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  29.75 
 
 
158 aa  53.9  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1748  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2631  MutT/nudix family protein  35.34 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3293  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  48.44 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  40 
 
 
143 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0703  putative ADP-ribose pyrophosphatase  44.62 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  43.75 
 
 
138 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
142 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 
147 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0336  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
261 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0738056  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
139 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  43.24 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
147 aa  51.2  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2968  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1679  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.164244  normal  0.63188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1561  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  41.89 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  32 
 
 
299 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  41.11 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  34.43 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  35.04 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  33.68 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2959  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
228 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.03 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.27 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.27 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0122  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.151364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  43.28 
 
 
315 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  27.81 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  41.94 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2232  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000560671  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  30.77 
 
 
269 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  47.95 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.68 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  35.4 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  40.3 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>