More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0722 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  100 
 
 
158 aa  295  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  72.92 
 
 
148 aa  217  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3355  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
84 aa  103  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.595371  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
141 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
163 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  39.13 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  40.43 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
179 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  38.26 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  38.26 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  38.26 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  39.8 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  37.63 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  36.56 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  36.08 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  31.91 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  36.84 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
299 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
141 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  35.05 
 
 
145 aa  51.2  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  35.71 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  33.72 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  35.05 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 
168 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
147 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  37.21 
 
 
158 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0751  mutT/nudix family protein  43.75 
 
 
109 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  36.08 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 
305 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  37.21 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2672  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0408434 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  31.65 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  36.08 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  30.58 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  35.45 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  36.08 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  35.05 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  29.75 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
148 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  39 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  48.33 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
236 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  31.71 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
205 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
157 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.64 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.8 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
142 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4733  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
147 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  30.49 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
144 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
341 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  44.44 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  35 
 
 
212 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.63 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  37.21 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
205 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>