129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03840 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
154 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  37.5 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
146 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
162 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
299 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
141 aa  54.7  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  30.37 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4099  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
137 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  27.63 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  26.97 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  26.97 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  28.29 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  28.29 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.71 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  44.29 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
267 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  27.63 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 
298 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
138 aa  48.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
173 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  32 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
282 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
169 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  26.35 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
182 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  30.17 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.17 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.17 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  28.19 
 
 
269 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  23.4 
 
 
162 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.17 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
136 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  23.84 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  31.4 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  24.83 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  25.66 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.76 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  31.3 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.84 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.76 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  45.76 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  30.23 
 
 
318 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  23.36 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  41.67 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  30.58 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  31.45 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  31.31 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
334 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.28 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  23.49 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 
131 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>