More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0754 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 282 aa  532  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 173 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.45 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  42.31 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 142 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  34.46 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  36.13 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  40.71 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 148 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 		 137 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  42.86 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 142 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 		 145 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  39.36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 156 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  47.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 158 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  46.03 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 155 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 155 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 155 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 155 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 		 132 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  51.16 
 
 		 168 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 124 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 		 147 aa  49.7  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 		 163 aa  49.3  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  32.38 
 
 		 172 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.3 
 
 		 156 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 135 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.38 
 
 		 134 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 136 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 134 aa  48.9  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 138 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  27.01 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  35.78 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.44 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2406  putative Nudix hydrolase family protein  37.5 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  36.27 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 141 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  45.33 
 
 		 570 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  34.83 
 
 		 137 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  45.07 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  26.72 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 141 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.04 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  41.27 
 
 		 141 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  44.59 
 
 		 139 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  40.32 
 
 		 153 aa  48.1  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33.63 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.8 
 
 		 158 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  43.86 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 139 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  30.65 
 
 		 159 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  43.42 
 
 		 155 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  61.54 
 
 		 172 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.69652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>