More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  100 
 
 
158 aa  313  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  41.78 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
142 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 
173 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
305 aa  81.3  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
298 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
299 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
315 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
361 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
168 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  36 
 
 
282 aa  61.6  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
304 aa  58.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.59 
 
 
473 aa  57.4  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  34.48 
 
 
269 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.53 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.53 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.87 
 
 
212 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
301 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  32.74 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
236 aa  54.3  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  42.62 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  30.63 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.63 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  42.62 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  42.62 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
255 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  25 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  25 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  25 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  37.37 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 
265 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  25 
 
 
164 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  42.62 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  31.86 
 
 
140 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  29.29 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  30.85 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  40.98 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  40.98 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  40.62 
 
 
181 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
124 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
181 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
134 aa  51.2  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  44.83 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  30.4 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  29.73 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
177 aa  50.8  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  50.72 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
153 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
219 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  49.21 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  32.03 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  30.37 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1854  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  39.39 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  36 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  29.79 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  29.79 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  39.34 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
126 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>