167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3133 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  322  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08300  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2559  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.340623 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  31.11 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
146 aa  57.4  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  31.06 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4099  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  29.77 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  29.77 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  30.53 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  30.53 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
218 aa  51.2  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  29.77 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  32.8 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  29.77 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
299 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  26.05 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  32 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  32.71 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  28.17 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
182 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  26.71 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1697  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0101183  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 
196 aa  47.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
200 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  24.79 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  26.06 
 
 
147 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  29.37 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  29.37 
 
 
173 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  27.34 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  26.61 
 
 
345 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  32.84 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0722  NUDIX hydrolase  24.24 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.421237  normal  0.366527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2012  NUDIX hydrolase, MutT  24.24 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  26.96 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  24.41 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  23.2 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  23.39 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  26.19 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  24.26 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
137 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  36.17 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  30.68 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
298 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
291 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
176 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  24.06 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  30 
 
 
140 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.73 
 
 
137 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  25.81 
 
 
345 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  27.73 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.82 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  27 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  29.46 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  27.73 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  27.73 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  31.37 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  36.62 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  37.14 
 
 
205 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  24.5 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  35.11 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0825  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  26.61 
 
 
346 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  45.45 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  41.94 
 
 
212 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>