More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5579 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  100 
 
 
173 aa  332  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 
146 aa  121  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  46 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
282 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
158 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  42.03 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
299 aa  87.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 
361 aa  75.1  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
304 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  40.37 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  37.01 
 
 
241 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
229 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
154 aa  62.8  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 
228 aa  62.8  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 
145 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
155 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  33.67 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
236 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  54.1 
 
 
212 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
209 aa  58.9  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  37.04 
 
 
269 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
133 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
209 aa  58.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  65 
 
 
156 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  31.96 
 
 
145 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3712  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.235582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  29.17 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3426  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  41.27 
 
 
137 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0344425  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
282 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  31.67 
 
 
144 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  32.65 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 
137 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  30.93 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
168 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
142 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  29.58 
 
 
164 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3779  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 
137 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  31.67 
 
 
144 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  30.93 
 
 
145 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 
120 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  36.96 
 
 
347 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  38.27 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
137 aa  54.3  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
157 aa  54.3  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.35 
 
 
138 aa  54.3  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.35 
 
 
138 aa  54.3  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
270 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.59 
 
 
137 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
270 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  28 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
270 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
171 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.37 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  32.17 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 
145 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  32.17 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>