More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0782 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  99.42 
 
 
171 aa  343  5e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
176 aa  106  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  40.99 
 
 
176 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  40.76 
 
 
176 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
176 aa  101  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  38.85 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  38.56 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  37.66 
 
 
180 aa  98.2  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
172 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  34.39 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
177 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
177 aa  92  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.13 
 
 
205 aa  90.9  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  32.9 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  32.05 
 
 
186 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  31.61 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
157 aa  57.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
216 aa  55.5  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
145 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
145 aa  54.3  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  29.41 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0582  dinucleoside polyphosphate hydrolase  30.4 
 
 
134 aa  52  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  48.28 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  32.99 
 
 
435 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
145 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
215 aa  50.8  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  43.14 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  30.3 
 
 
434 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 
131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 
149 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  41.38 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1427  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  54.17 
 
 
131 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
142 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
147 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  28.76 
 
 
132 aa  48.9  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4725  NUDIX hydrolase  26 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
144 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
205 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  39.66 
 
 
205 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  49.15 
 
 
137 aa  48.5  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  46.27 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  31.33 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  47.76 
 
 
137 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  39.08 
 
 
131 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  39.08 
 
 
131 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  35.48 
 
 
136 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  48.28 
 
 
129 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  41.79 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  41.79 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  41.79 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  30.43 
 
 
129 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  45.31 
 
 
136 aa  47.4  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  39.66 
 
 
205 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  52.08 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  50 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
130 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  39.66 
 
 
205 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  54.17 
 
 
132 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  39.66 
 
 
205 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  48.15 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  34.71 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  52.08 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3111  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0922721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  34.71 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  48.15 
 
 
138 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  36.73 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  50 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>