155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1208 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 145 aa  290  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  98.62 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  84.14 
 
 		 145 aa  228  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  61.97 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  60.69 
 
 		 147 aa  177  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  60.69 
 
 		 146 aa  172  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 147 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  30.71 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  32.54 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  29.84 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  29.73 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3072  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  30.95 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  29.03 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  29.46 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  27.42 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2779  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  30.36 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  27.03 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  27.03 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  27.03 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 311 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3089  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  27.64 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  28.57 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3056  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  30.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  30.95 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  29.17 
 
 		 173 aa  47.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2646  MutT/Nudix family protein  29.76 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.785802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4804  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.483514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 281 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  28.68 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  27.38 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 190 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0604  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0701215  normal  0.289612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 305 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.44 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.44 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0843  NUDIX family hydrolase  26.77 
 
 		 166 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 		 147 aa  42.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  26.21 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  32.88 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1777  NAD(+) diphosphatase  36.25 
 
 		 282 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 211 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.91 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  31.4 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 315 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.59 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  32 
 
 		 317 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.67 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 172 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 146 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5187  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 171 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.466723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 155 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 180 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 		 197 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>