268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0494 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  60.69 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  61.87 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 145 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3486  NUDIX hydrolase  52.82 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 		 147 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3091  mutT/nudix family protein  34.19 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.030376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2846  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2819  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  32.26 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3060  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.780249  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3089  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0777965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2779  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  32.89 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3072  mutT/nudix family protein  32.26 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2190  mutT/nudix family protein  30.32 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000611721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3056  mutT/nudix family protein  31.37 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0647  MutT/nudix family protein  26.92 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.24 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  53.57 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 282 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1264  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.879303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 199 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2537  NUDIX family hydrolase  27.13 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  37.5 
 
 		 180 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.23 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 		 179 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  43.33 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 		 281 aa  47.8  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  50.88 
 
 		 299 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  34.86 
 
 		 255 aa  46.2  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.78 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2785  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.78 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  26.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0724  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.78 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776975  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  39.34 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2718  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2669  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2926  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.77 
 
 		 473 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2925  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.38475e-24 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  24.8 
 
 		 171 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  45.76 
 
 		 260 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 177 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 311 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  23.39 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  30.23 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  38.24 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 153 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  25.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  37.7 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 181 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  36.47 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4612  ADP-ribose diphosphatase NudE  30.53 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  43.1 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  34.21 
 
 		 301 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  35.14 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 186 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  32.76 
 
 		 143 aa  43.5  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  24 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  31 
 
 		 310 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.78 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  39.34 
 
 		 173 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>