100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1553 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1553  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  364  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000488772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1812  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  70.93 
 
 
205 aa  270  7e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.175472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  62.57 
 
 
180 aa  241  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  63.37 
 
 
172 aa  240  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  63.37 
 
 
172 aa  238  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1356  putative MutT/NUDIX family protein  61.99 
 
 
173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0463  NUDIX hydrolase  61.63 
 
 
172 aa  229  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2946  NUDIX hydrolase  61.93 
 
 
180 aa  228  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.908367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  58.19 
 
 
178 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  64.52 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
187 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  55.23 
 
 
186 aa  213  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
177 aa  204  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
180 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
180 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
176 aa  200  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
176 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 
176 aa  194  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 
176 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  55.68 
 
 
176 aa  190  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 
176 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5172  NUDIX hydrolase  46.02 
 
 
177 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2666  NUDIX hydrolase  45.66 
 
 
175 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.271242  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  38.06 
 
 
171 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  37.42 
 
 
171 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
303 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  38.03 
 
 
325 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  34.85 
 
 
231 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  26.56 
 
 
229 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2869  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
145 aa  47.8  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.855553  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  48.78 
 
 
317 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0555  NUDIX hydrolase  42 
 
 
149 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00430973 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
146 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  40.32 
 
 
315 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
237 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
314 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  46.34 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2888  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
122 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  42 
 
 
149 aa  45.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
122 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 
314 aa  45.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
302 aa  44.7  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
137 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
137 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  22.79 
 
 
212 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
322 aa  44.3  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
303 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
315 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  38.81 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
122 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  33.96 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  37.14 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
173 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
282 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  40.35 
 
 
241 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  41.46 
 
 
305 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.46 
 
 
336 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  25.81 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
322 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 
169 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
140 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
341 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  41.82 
 
 
167 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
166 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2328  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.07 
 
 
173 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.42836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 
155 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1725  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
146 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.430045  hitchhiker  0.00283332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03840  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 
155 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.51 
 
 
162 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
324 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  31.96 
 
 
105 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0072  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
216 aa  40.8  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
147 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
195 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
208 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>