200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1319 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  29.01 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  32.39 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  35.9 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  38.66 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  30.32 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  32.5 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 
157 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  29.68 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  33.57 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  33.57 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  26.8 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  34.09 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  58.54 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  35.63 
 
 
148 aa  52  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
148 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  29.08 
 
 
434 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
158 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 
170 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
153 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  26.58 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0230  NUDIX hydrolase  26.43 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  32.52 
 
 
396 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.85 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
182 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  56.1 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  56.1 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  38.36 
 
 
168 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.91 
 
 
368 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
162 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  27.17 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1918  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
151 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
140 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  30.4 
 
 
435 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0536  MutT/nudix family protein  27.48 
 
 
186 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 
140 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1157  MutT/NUDIX family protein  34.38 
 
 
180 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  30 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.77 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  24.53 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  24.53 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  44.07 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  31.34 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  34.57 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  55.56 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  30 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  26.72 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  26.13 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  30 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  24.53 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  25.68 
 
 
155 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  27.82 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  42.37 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33 
 
 
441 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
135 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 
176 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
139 aa  43.5  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
151 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>