70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1483 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  100 
 
 
148 aa  296  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  89.86 
 
 
151 aa  270  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  88.51 
 
 
151 aa  266  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 
151 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  34.53 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  32.86 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  33.81 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  31.65 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  31.65 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  30.22 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  33.82 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  30.22 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  32.73 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  28.46 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  29.91 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  42.65 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
166 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
163 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  40 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  44.07 
 
 
316 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  45.61 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  40 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  52.38 
 
 
314 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  38.33 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
148 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  50 
 
 
166 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.12 
 
 
142 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  30.69 
 
 
167 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  43.86 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  50 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  35.59 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  47.62 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  33.57 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  40.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  70.37 
 
 
143 aa  40.4  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  27.27 
 
 
169 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  47.62 
 
 
149 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  47.62 
 
 
149 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>