57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2640 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  100 
 
 
148 aa  300  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  62.59 
 
 
153 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
140 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
140 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
143 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
143 aa  87  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  30.71 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  30.94 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  30.6 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  30.6 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  30.6 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  30 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  30 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  35.46 
 
 
151 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  30.99 
 
 
146 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
144 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  27.46 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  28.87 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  28.17 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  33.77 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  31.19 
 
 
146 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  29.2 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  34.09 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  34.94 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  31.52 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  37.29 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  31.52 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  32.95 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0246  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 
271 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  37.29 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  37.29 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1867  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
183 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  35.59 
 
 
157 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  32.47 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
340 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0862  NUDIX family hydrolase  40 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000267263  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0285  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
147 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
163 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  31.29 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
158 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>