60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3750 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3750  NUDIX hydrolase  100 
 
 
143 aa  290  5e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0007  NUDIX hydrolase  61.27 
 
 
143 aa  194  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.768142  normal  0.930196 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
140 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4745  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
144 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.710264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4467  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0490  mutT/nudix family protein  37.04 
 
 
144 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4771  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4772  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4380  MutT/Nudix family protein  35.56 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4534  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4887  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4370  MutT/Nudix family protein  36.59 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4754  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 
137 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2640  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
148 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249433  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0938  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244188  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0858  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
144 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1482  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1483  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.084812  normal  0.135646 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1760  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
151 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  25 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  25 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  25 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  32 
 
 
305 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1319  ADP-ribose pyrophosphatase  28.95 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0720149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2790  phosphohydrolase  30 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  23.94 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  29.63 
 
 
169 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 
298 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  25 
 
 
155 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  25.83 
 
 
157 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  25 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  21.15 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
170 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  25 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  29.85 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
299 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  35.48 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  24.17 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  30 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  25.21 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  26 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  25.21 
 
 
155 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  27.71 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  25.35 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  24.65 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  35 
 
 
169 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 
169 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  30 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
288 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  36.23 
 
 
162 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  32.69 
 
 
131 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>