More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0110 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  275  2e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  55.12 
 
 
149 aa  153  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  54.03 
 
 
138 aa  144  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  52.8 
 
 
143 aa  142  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
146 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
134 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  34.92 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  30.33 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  55.74 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  41.49 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
180 aa  58.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 
171 aa  58.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  45.16 
 
 
164 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  51.47 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
145 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  36 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  31.39 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  32.12 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  56 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  27.97 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  27.97 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  30 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
154 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  31.39 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  41.27 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
149 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  52 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  32.84 
 
 
158 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  52 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  31.39 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  31.39 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  31.39 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  31.39 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  48.44 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  31.39 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 
147 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  33.05 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  27.27 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
261 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  32.86 
 
 
314 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  33.05 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  41.54 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  29.41 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  31.09 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  36 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
141 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
382 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
137 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
139 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  34.19 
 
 
272 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
154 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  35.64 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  40 
 
 
154 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  30.25 
 
 
132 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  41.54 
 
 
141 aa  51.2  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  31.9 
 
 
269 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  28.99 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  31.34 
 
 
316 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
334 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
154 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  28.99 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>