199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1790 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  100 
 
 
200 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  61.14 
 
 
204 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 
184 aa  181  6e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  58.08 
 
 
205 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  53.64 
 
 
172 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  51.22 
 
 
174 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  42.7 
 
 
327 aa  122  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
340 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 
347 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
347 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
148 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  35.47 
 
 
351 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
341 aa  90.9  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
164 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  36.3 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
153 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  43.92 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
149 aa  74.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 
153 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  37.4 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
441 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1525  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.2695  normal  0.533617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1805  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0770622 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
151 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0576  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
141 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
361 aa  55.5  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  37.89 
 
 
157 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
166 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  35.97 
 
 
315 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2460  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00334111  normal  0.173261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
158 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  32.04 
 
 
173 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 
140 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 
140 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
305 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 
163 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.58 
 
 
163 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  27.34 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  37.59 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 
155 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
299 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 
146 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
160 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 
165 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  44.78 
 
 
129 aa  47.8  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  41.03 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  44.78 
 
 
129 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
156 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  32 
 
 
146 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2406  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1584  NAD(+) diphosphatase  33.04 
 
 
330 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0238649  normal  0.338548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000745  MutT/nudix family protein  46.88 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2723  NUDIX hydrolase  46.48 
 
 
178 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.346967  hitchhiker  0.000510454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3699  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
152 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224452  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  32.58 
 
 
148 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
165 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 
298 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.06 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1457  NUDIX family hydrolase  35.37 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0054523  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
304 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
130 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
168 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04903  hypothetical protein  45.31 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 
155 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  39.74 
 
 
141 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3633  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 
153 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
132 aa  44.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
146 aa  45.1  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  36.89 
 
 
160 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  36.89 
 
 
160 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.4 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>