75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3833 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  100 
 
 
347 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  84.15 
 
 
347 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  72 
 
 
337 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  72 
 
 
337 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  72 
 
 
337 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  69 
 
 
351 aa  361  9e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  48.54 
 
 
340 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 
327 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  44.1 
 
 
341 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  55.92 
 
 
177 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
174 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1790  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
200 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0789359  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
148 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  63.38 
 
 
170 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  36.42 
 
 
205 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  36 
 
 
172 aa  86.7  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1663  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
184 aa  86.3  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.141747  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1987  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 
204 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  39.2 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
159 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  42.57 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  38.1 
 
 
179 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4004  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
166 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  39.75 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  39.87 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
137 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  42.61 
 
 
199 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  37.36 
 
 
183 aa  67  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2912  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4022  NUDIX hydrolase  32.91 
 
 
153 aa  63.9  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0654  NUDIX hydrolase  29.65 
 
 
164 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  37.58 
 
 
177 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2052  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
153 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216092  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4799  nudix hydrolase  29.49 
 
 
159 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  41.45 
 
 
180 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  34.48 
 
 
225 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  36.36 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  32.14 
 
 
234 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
157 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  29.29 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7098  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
166 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191544  normal  0.239694 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3815  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 
151 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  37.65 
 
 
181 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
158 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3529  hypothetical protein  33.9 
 
 
149 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.21794  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
170 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
151 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  33.53 
 
 
198 aa  46.2  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  52.17 
 
 
148 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
155 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
155 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
167 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  38.57 
 
 
158 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
149 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
156 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2445  NUDIX hydrolase  35 
 
 
169 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.123324  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.66 
 
 
159 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  39.02 
 
 
160 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  39.02 
 
 
160 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
157 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  27.08 
 
 
155 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3498  NAD(+) diphosphatase  30.48 
 
 
310 aa  43.5  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
456 aa  43.1  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
149 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
134 aa  42.7  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
152 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 
146 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>