29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5151 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  65.06 
 
 		 180 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  40.57 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  40.61 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  37.71 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  38.98 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  41.03 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  36.16 
 
 		 179 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  41.03 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.31 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  37.93 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  38.55 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  37.57 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  36.56 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  31.5 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  48.91 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  37.22 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  38.75 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  29.3 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  46.59 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  38.89 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 341 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  42.17 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  29.41 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  28.99 
 
 		 180 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>