28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1984 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1984  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  353  6.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470918  hitchhiker  0.00979887 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  47.46 
 
 		 198 aa  120  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  43.5 
 
 		 234 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  43.48 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  45.11 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  38.76 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  43.39 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  38.86 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  42.7 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  37.78 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  45.52 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  41.51 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  38.82 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  34.64 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  36.9 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 340 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  35.03 
 
 		 341 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  42.22 
 
 		 167 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  31.79 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  33.53 
 
 		 167 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 347 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  35.44 
 
 		 170 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  25.29 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 337 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 337 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 		 337 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>