245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2258 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  58.1 
 
 
183 aa  204  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  56.33 
 
 
188 aa  181  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  46.07 
 
 
183 aa  180  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  48.04 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  52.33 
 
 
188 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  46.63 
 
 
184 aa  177  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  51.81 
 
 
186 aa  176  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  52.47 
 
 
180 aa  175  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  57.14 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.47 
 
 
183 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  46.47 
 
 
183 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  45.88 
 
 
183 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  46.7 
 
 
192 aa  167  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  45.51 
 
 
184 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  47.27 
 
 
186 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  48.21 
 
 
184 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.06 
 
 
186 aa  164  9e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  50.62 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.37 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  48.57 
 
 
196 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  47.67 
 
 
192 aa  160  7e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  46.67 
 
 
185 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  49.11 
 
 
181 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  46.99 
 
 
199 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  47.06 
 
 
185 aa  159  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  42.49 
 
 
194 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  49.38 
 
 
249 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  45.73 
 
 
186 aa  156  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  46.99 
 
 
182 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  40 
 
 
185 aa  154  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  43.83 
 
 
189 aa  154  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  46.2 
 
 
198 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  47.24 
 
 
186 aa  152  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  43.02 
 
 
184 aa  152  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  45.78 
 
 
195 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  46.45 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  41.07 
 
 
189 aa  151  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  42.78 
 
 
201 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  46.91 
 
 
187 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  42.78 
 
 
201 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  41.53 
 
 
183 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.67 
 
 
196 aa  148  4e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  46.3 
 
 
208 aa  148  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.04 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  41.76 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  45.81 
 
 
195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  40.24 
 
 
188 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  39.89 
 
 
183 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  40.22 
 
 
182 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  39.89 
 
 
202 aa  144  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40 
 
 
196 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  43.9 
 
 
189 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  39.79 
 
 
197 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  39.01 
 
 
187 aa  141  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  48.05 
 
 
196 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  46.37 
 
 
193 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  37.87 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  37.7 
 
 
197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  37.87 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  46.37 
 
 
193 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  45.34 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  44.83 
 
 
193 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  42.26 
 
 
186 aa  137  7e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  37.28 
 
 
180 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  45.27 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  39.13 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  42.05 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  39.44 
 
 
192 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  40.56 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  39.34 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  34.66 
 
 
180 aa  131  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  43.03 
 
 
187 aa  131  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  35.5 
 
 
180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  43.62 
 
 
196 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  37.99 
 
 
197 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  37.78 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  40.96 
 
 
434 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  36.76 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  40.46 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  38.29 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  37.72 
 
 
437 aa  125  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  39.61 
 
 
195 aa  124  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  41.29 
 
 
179 aa  125  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  39.13 
 
 
433 aa  124  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  42.58 
 
 
177 aa  124  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.71 
 
 
182 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  38.41 
 
 
190 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.81 
 
 
189 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  38.75 
 
 
434 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  34.92 
 
 
217 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  41.52 
 
 
187 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  36.79 
 
 
211 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  41.61 
 
 
192 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  35.98 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  36.36 
 
 
246 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  39.39 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  36.98 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  36.98 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  36.98 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>