64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3183 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  344  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2348  hypothetical protein  37.87 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2292  hypothetical protein  41.61 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  41.4 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1789  hypothetical protein  39.76 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5151  hypothetical protein  40.88 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0394065  decreased coverage  0.0000949613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1776  hypothetical protein  38.12 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1365  hypothetical protein  41.18 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.394746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2247  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2294  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2286  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 337 aa  64.7  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6123  hypothetical protein  32.93 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.491402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2563  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3833  NUDIX hydrolase  41.33 
 
 		 347 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604823  normal  0.0662029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  25.6 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12628  hypothetical protein  39.51 
 
 		 351 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2103  hypothetical protein  35.2 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  42.39 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3417  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000769594  hitchhiker  0.0000248921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1352  secreted protein  37.93 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117285  normal  0.456923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3061  hypothetical protein  35.39 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.035322  normal  0.205092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  25.71 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  28.77 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2100  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.301548  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1788  hypothetical protein  33.89 
 
 		 225 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0158619  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14980  hypothetical protein  41.61 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1661  hypothetical protein  32.75 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.161543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  23.73 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  26.62 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  27.33 
 
 		 189 aa  47.8  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  30.46 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  27.27 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  26.88 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  26.92 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  29.09 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  29.25 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  29.09 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  29.09 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  25.81 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  28.16 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17460  hypothetical protein  29.44 
 
 		 234 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.602251  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  32.79 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.56 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  26.42 
 
 		 180 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  27.22 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  25 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2071  hypothetical protein  32.69 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.261498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  29.05 
 
 		 437 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1373  hypothetical protein  26.24 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0713902 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  29.25 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  27.54 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.82 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  26.35 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  26.75 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  26.63 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  30.95 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  25.68 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  28.28 
 
 		 185 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  26.67 
 
 		 201 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  26.38 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0822  hypothetical protein  40.48 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151964  normal  0.0607124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  31.76 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  29.09 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>