243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1519 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  53.8 
 
 
192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  48.47 
 
 
202 aa  181  9.000000000000001e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  50 
 
 
185 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  51.2 
 
 
185 aa  174  8e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  52.66 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  51.23 
 
 
208 aa  167  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  50.62 
 
 
187 aa  166  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  50.6 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  46.19 
 
 
193 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  46.99 
 
 
186 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  48.52 
 
 
184 aa  156  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  44.5 
 
 
217 aa  154  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  43.15 
 
 
194 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  45.92 
 
 
212 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  45.78 
 
 
181 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  42.19 
 
 
194 aa  148  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  41.62 
 
 
199 aa  148  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  43.37 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  47.88 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  43.01 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  39.57 
 
 
183 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  38.62 
 
 
184 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.26 
 
 
186 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  44.77 
 
 
194 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  45.45 
 
 
186 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  45.83 
 
 
249 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  43.23 
 
 
197 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  44.19 
 
 
194 aa  140  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.08 
 
 
186 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  42.7 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  44.85 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  41.85 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  42 
 
 
201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  45.25 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  41.85 
 
 
183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  44.85 
 
 
188 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  41.15 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40.12 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  46.51 
 
 
194 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  43.08 
 
 
215 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  40.65 
 
 
214 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  40.19 
 
 
206 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  43.33 
 
 
196 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  42.21 
 
 
197 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  41.3 
 
 
183 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  39.59 
 
 
194 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  39.89 
 
 
183 aa  134  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  39.46 
 
 
184 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  40 
 
 
195 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  41.75 
 
 
194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  43.02 
 
 
194 aa  132  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  39.34 
 
 
181 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  48.99 
 
 
206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  39.69 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  38.86 
 
 
210 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  44.12 
 
 
189 aa  131  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  40.51 
 
 
201 aa  130  9e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  41.71 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  37.22 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  43.79 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  39.59 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  39.59 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  39.09 
 
 
211 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  41.24 
 
 
207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  40.61 
 
 
208 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  40.98 
 
 
200 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  41.24 
 
 
207 aa  129  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  42.05 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  40.91 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  40.2 
 
 
202 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0879  hypothetical protein  37.75 
 
 
208 aa  127  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238242  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  41.36 
 
 
180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  37.5 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  38.38 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  46.24 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  40.2 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  41.92 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  45.78 
 
 
211 aa  125  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  43.93 
 
 
222 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  37.62 
 
 
197 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  38.6 
 
 
185 aa  126  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  42.56 
 
 
211 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  38.42 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  47.31 
 
 
246 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  41.95 
 
 
204 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  39.81 
 
 
210 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  41.3 
 
 
220 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  43.93 
 
 
226 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  43.93 
 
 
224 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  38 
 
 
208 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  38.2 
 
 
184 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  37.3 
 
 
184 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  39.7 
 
 
218 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  38.31 
 
 
210 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>