244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1832 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  66.12 
 
 		 196 aa  261  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  62.98 
 
 		 196 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  60.43 
 
 		 196 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  64.2 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  60.66 
 
 		 201 aa  224  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  63.16 
 
 		 194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  55.05 
 
 		 195 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  61.54 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  59.56 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  60.23 
 
 		 195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  57.39 
 
 		 196 aa  208  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  54.55 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  51.3 
 
 		 197 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  64.94 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  65.79 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  65.13 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  52.91 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  57.62 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  46.43 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.67 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  50.55 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  44.39 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  47.73 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  54.39 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  46.35 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.83 
 
 		 183 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  44.9 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  49.71 
 
 		 186 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  45.83 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.43 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  42.56 
 
 		 183 aa  154  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  46.2 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  42.78 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  46.33 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  46.5 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  44.04 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  38.78 
 
 		 184 aa  142  5e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  44.51 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  43.01 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  42.93 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.41 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  37.88 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  44.13 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  39.69 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  39.38 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  43.27 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  40.48 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  46.71 
 
 		 189 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  42.08 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  44.69 
 
 		 185 aa  130  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  40.2 
 
 		 249 aa  130  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  40.72 
 
 		 182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  42.94 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.05 
 
 		 186 aa  129  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  38.62 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.17 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  37.23 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  36.92 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.54 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  37.31 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  42.86 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  38.59 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  37.31 
 
 		 207 aa  125  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  37.31 
 
 		 207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  40.34 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  47.18 
 
 		 202 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  35.64 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  37.77 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  39.89 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  38.15 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  42.95 
 
 		 215 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  39.77 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  35.82 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  42.95 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  44.08 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  38.95 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  38.64 
 
 		 180 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  37.87 
 
 		 185 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  39.04 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  39.39 
 
 		 212 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  41.04 
 
 		 246 aa  121  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  35.23 
 
 		 180 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  37.5 
 
 		 211 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  38.59 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  39.77 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  37.5 
 
 		 211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  39.33 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  38.67 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  39.89 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  34.66 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  36.6 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  36.41 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  34.66 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  38.12 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  39.34 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  37.76 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  37.08 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>