240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0089 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  66.86 
 
 
191 aa  248  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  64.53 
 
 
190 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  65.7 
 
 
190 aa  237  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  58.7 
 
 
190 aa  228  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  58.38 
 
 
191 aa  226  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  47.03 
 
 
189 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  44.25 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  46.95 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  44.13 
 
 
183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.68 
 
 
183 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  42.77 
 
 
186 aa  141  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  43.5 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  43.29 
 
 
184 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  42.31 
 
 
184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  41.72 
 
 
183 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  42.44 
 
 
186 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  41.1 
 
 
183 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  42.59 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  41.36 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  46.1 
 
 
184 aa  132  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  45.21 
 
 
188 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  40.12 
 
 
201 aa  131  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  39.31 
 
 
183 aa  131  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.37 
 
 
186 aa  131  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  45.52 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  38.71 
 
 
195 aa  130  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  42.54 
 
 
197 aa  130  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  41.28 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.45 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  43.29 
 
 
182 aa  127  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  36.76 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  40.88 
 
 
197 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  42.14 
 
 
196 aa  124  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  39.05 
 
 
196 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  43.21 
 
 
183 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  36.84 
 
 
185 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  40.25 
 
 
199 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  37.58 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  39.34 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  40.25 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  41.22 
 
 
184 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  118  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  38.95 
 
 
194 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  38.55 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  39.52 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  40.35 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  43.42 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  37.5 
 
 
182 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  39.31 
 
 
186 aa  115  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  38.16 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  37.72 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  32.77 
 
 
185 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  35.91 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  33.71 
 
 
217 aa  112  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  36.9 
 
 
182 aa  111  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  36.84 
 
 
249 aa  111  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  36.59 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  34.81 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  36.87 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.42 
 
 
189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  34.91 
 
 
192 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  34.97 
 
 
180 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  32.79 
 
 
202 aa  108  7.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  34.97 
 
 
180 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  34.97 
 
 
180 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  33.13 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  36.42 
 
 
185 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  39.22 
 
 
189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  38.67 
 
 
195 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.04 
 
 
198 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  36.88 
 
 
192 aa  104  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  34.5 
 
 
187 aa  102  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  33.92 
 
 
185 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  35.15 
 
 
201 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  38.46 
 
 
193 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  34.52 
 
 
193 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  36.11 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  37.93 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  31.03 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  39.6 
 
 
193 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  35.26 
 
 
192 aa  98.2  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  31.46 
 
 
193 aa  97.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  34.51 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  37.24 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  36.42 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  36.59 
 
 
197 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  38.26 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  31.93 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  36.55 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  34.18 
 
 
185 aa  94.7  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  32.54 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  30.67 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  32.22 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  33.71 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  32.79 
 
 
437 aa  92.8  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  35.62 
 
 
215 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  35.62 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  33.53 
 
 
212 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  28.04 
 
 
188 aa  90.9  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>