243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3150 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  65.31 
 
 		 198 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  67.96 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  65.93 
 
 		 201 aa  234  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  65.93 
 
 		 201 aa  223  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  64.77 
 
 		 195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  58.33 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  62.5 
 
 		 196 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  63.64 
 
 		 195 aa  214  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  64.29 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  62.05 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  53.85 
 
 		 195 aa  204  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  55.93 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  59.88 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  60 
 
 		 193 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  51.27 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  59.41 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  53.07 
 
 		 197 aa  175  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  56.6 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  49.23 
 
 		 188 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  52.2 
 
 		 188 aa  168  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  47.69 
 
 		 184 aa  168  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  49.49 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  47.96 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  48.88 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  47.69 
 
 		 183 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.94 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  48.45 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  46.11 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  51.37 
 
 		 188 aa  164  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  48.31 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.84 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  42.22 
 
 		 186 aa  143  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.94 
 
 		 183 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  41.33 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  42.71 
 
 		 183 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  42.71 
 
 		 183 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  48.08 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  45.3 
 
 		 249 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  42.5 
 
 		 181 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  41.12 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  45.25 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  41.97 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  38.27 
 
 		 184 aa  131  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  42.62 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  44.32 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  40.34 
 
 		 189 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.76 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  39.2 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  39.2 
 
 		 193 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  41.57 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  41.21 
 
 		 181 aa  125  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  40.44 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  39.67 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  45.39 
 
 		 186 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  40.91 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.84 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  38.89 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  41.48 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  39.53 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  41.99 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  38.46 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  41.48 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  38.5 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  42.95 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  42.95 
 
 		 215 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  43.09 
 
 		 192 aa  121  8e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  39.38 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.58 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  37.91 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  39.29 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  39.29 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  36.55 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  38.07 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  41.45 
 
 		 182 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  35.05 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  35.05 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  40.22 
 
 		 185 aa  118  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  40.76 
 
 		 187 aa  118  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.95 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  39.38 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  37.06 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  41.46 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  34.54 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  44.16 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  36.36 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  36.36 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  36.98 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  39.77 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  40.57 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  40.85 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  40.85 
 
 		 193 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  38.78 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  38.27 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  35.8 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  41.21 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.53 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  38.32 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  37.3 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  39.55 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>