241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2798 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  61.58 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  63.37 
 
 		 190 aa  232  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  58.7 
 
 		 188 aa  228  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  55.79 
 
 		 191 aa  224  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  61.27 
 
 		 191 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  52.1 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  41.76 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.88 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.29 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  36.61 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.07 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  38.86 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  38.64 
 
 		 186 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.24 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  38.73 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  42.86 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  38.29 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.08 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.21 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  46.01 
 
 		 195 aa  128  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  41.88 
 
 		 188 aa  127  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  44.22 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  41.42 
 
 		 196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  36.26 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  40.21 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  38.04 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  40.76 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  40.24 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  35.71 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  41.71 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.44 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.41 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  40.49 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  39.04 
 
 		 198 aa  121  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  40.83 
 
 		 194 aa  121  7e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.44 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  38.41 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  38.75 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  38.37 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  40.94 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  40.61 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  36.81 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  37.36 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  33.53 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  36.53 
 
 		 182 aa  111  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  32.95 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  32.95 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  38.82 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  41.88 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.89 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  32.39 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  34.55 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  34.15 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  35.5 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  37.42 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  31.05 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  36.88 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.95 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.53 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  37.2 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  37.2 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  30.27 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  36.18 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  33.74 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  36.88 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  39.77 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  33.53 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  36.97 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  34.12 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  33.95 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  32.93 
 
 		 217 aa  98.2  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  32.78 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  30.05 
 
 		 202 aa  97.8  8e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  41.32 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  40 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  42.24 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  34.5 
 
 		 212 aa  95.5  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  35.37 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  35.09 
 
 		 244 aa  94.7  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  33.93 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  33.73 
 
 		 437 aa  94.4  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  37.58 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  36.9 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  32.94 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  37.25 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  33.55 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  37.25 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  34.66 
 
 		 212 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  36.65 
 
 		 194 aa  91.3  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  36.31 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  33.33 
 
 		 177 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>