238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1779 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2465  LemA family protein  70.12 
 
 
191 aa  244  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  67.47 
 
 
187 aa  239  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  64.46 
 
 
189 aa  236  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  33.89 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  35.36 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  33.71 
 
 
183 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  33.52 
 
 
184 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  33.7 
 
 
183 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  35.12 
 
 
181 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  35.12 
 
 
184 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  33.51 
 
 
192 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  33.51 
 
 
185 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  33.15 
 
 
183 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  33.93 
 
 
189 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  32.6 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  35.67 
 
 
189 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  35.5 
 
 
249 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  33.7 
 
 
183 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  36.99 
 
 
184 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  33.7 
 
 
183 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  35.45 
 
 
184 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  34.97 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  34.13 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  32.14 
 
 
198 aa  99  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  32.58 
 
 
196 aa  99  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  31.89 
 
 
186 aa  99  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.98 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  35.03 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  34.48 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  34.44 
 
 
196 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  34.48 
 
 
180 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  33.13 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.57 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  30.11 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  31.49 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  35.8 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  33.91 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  34.78 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.95 
 
 
208 aa  94  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  34.25 
 
 
196 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  35.9 
 
 
188 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  33.69 
 
 
197 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  31.15 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  35.81 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  32.18 
 
 
196 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  32.56 
 
 
192 aa  91.7  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  32.14 
 
 
185 aa  91.7  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  34.22 
 
 
197 aa  91.3  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  30.36 
 
 
189 aa  90.9  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  32.56 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  32.22 
 
 
201 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  30.59 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  31.41 
 
 
195 aa  89.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  36.31 
 
 
190 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  32.73 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  33.97 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  34.84 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  31.52 
 
 
187 aa  88.6  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  30.21 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  31.21 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  32.63 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0120  LemA family protein  30.12 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000229196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  28.83 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  33.52 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  30.18 
 
 
181 aa  85.5  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  33.52 
 
 
197 aa  85.1  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  32.57 
 
 
195 aa  85.1  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  34.29 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  35.17 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  33.33 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  33.13 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  34.64 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  35.06 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  31.33 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  29.51 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  32.46 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  29.63 
 
 
189 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  34.38 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  29.81 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  32.21 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  32.14 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  28.57 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  32.63 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  31.82 
 
 
208 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  31.43 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  31.82 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  29.45 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  23.32 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  32.31 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  28.89 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  27.47 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  27.61 
 
 
192 aa  80.1  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  31.61 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  28.57 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  32.95 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  26.84 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  31.82 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  26.38 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  31.25 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>