206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0555 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0555  LemA family protein  100 
 
 		 192 aa  386  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000372284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  34.42 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  27.22 
 
 		 249 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  29.11 
 
 		 189 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  31.55 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  32.46 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  32.46 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  32.46 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  30.11 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  30.19 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  30.59 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  31.95 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  30.59 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  30.59 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  32.68 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  30.06 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  31.03 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  28.57 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  30.77 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  28.49 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  31.03 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  31.03 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  31.14 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1779  hypothetical protein  27.22 
 
 		 185 aa  89.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  30.81 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  30.12 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  27.22 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  29.76 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  28.92 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  29.52 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  29.52 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  29.19 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  33.73 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  30 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  31.25 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  29.87 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  29.87 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  29.81 
 
 		 189 aa  85.9  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2686  LemA family protein  30.52 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  30.46 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  25.81 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  30.46 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  32.93 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  28.14 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  27.54 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2382  hypothetical protein  30.52 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.119031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2429  LemA family protein  30.52 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  0.270155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2423  LemA family protein  30.52 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0706074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  26.86 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  30.41 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  29.61 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  27.54 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  31.08 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  28.24 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  27.37 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  29.17 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  27.53 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  29.88 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  27.88 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  25.61 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  27.88 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  29.75 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  26.97 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  27.44 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  28.57 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  29.19 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  26.86 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2447  LemA family protein  29.22 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.977457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  26.99 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2465  LemA family protein  29.8 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  25.66 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  29.11 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  28.76 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  25.47 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  24.68 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  34.09 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  25 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  27.06 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  26.79 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  25.17 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  31.06 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  29.53 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  26.35 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  27.5 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25170  hypothetical protein  27.21 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  27.89 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  28.93 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  28.99 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  24.39 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0788  LemA family protein  27.5 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.258526  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0849  LemA family protein  23.78 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  28.16 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  27.46 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  24.39 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  28.08 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  32.21 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  32.21 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  24.29 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4437  LemA family protein  22.75 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>