249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3528 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  55.23 
 
 		 187 aa  208  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  52.97 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  51.34 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  51.91 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  51.91 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  50.81 
 
 		 183 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  49.73 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  51.37 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  52 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  46.29 
 
 		 188 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.59 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50.33 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  40.64 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  39.78 
 
 		 188 aa  157  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  46.47 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.18 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  45.29 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  41.4 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  49.67 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  41.4 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  53.15 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  42.93 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.25 
 
 		 184 aa  151  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  46.89 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  42.05 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  39.04 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  48.61 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  44.32 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  43.48 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  43.6 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  45 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  43.23 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  43.79 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  40.32 
 
 		 182 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  48.73 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  41.85 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  41.29 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  43.18 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  38.89 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  43.16 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.58 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  39.18 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  42.93 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  38.98 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  43.23 
 
 		 249 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  39.89 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  43.01 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  37.08 
 
 		 188 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  43.03 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  40 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  43.1 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  40.13 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  43.9 
 
 		 191 aa  134  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  42.42 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  42.42 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  40.96 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  40.21 
 
 		 192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  39.64 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  38.25 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  42.35 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  42.35 
 
 		 180 aa  131  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  39.75 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  40.36 
 
 		 208 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  41.46 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  38.22 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  42.95 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  39.53 
 
 		 186 aa  128  5.0000000000000004e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  39.55 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  37.04 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  40.65 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.65 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.16 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  35.53 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  41.42 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  40.88 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  39.86 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  39.33 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  36.87 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  39.33 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  45.45 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  38.92 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  39.26 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.85 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  38.37 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  37.65 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  37.19 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  35.79 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  39.55 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  37.19 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  43.94 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  41.9 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  45.95 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  45.39 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  41.72 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  38.1 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  38.02 
 
 		 211 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  37.13 
 
 		 434 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  41.38 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  37.08 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>