244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1607 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  73.58 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  74.29 
 
 		 195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  64.64 
 
 		 201 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  65.19 
 
 		 201 aa  239  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  66.29 
 
 		 196 aa  235  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  67.24 
 
 		 195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  60.43 
 
 		 198 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  54.36 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  60.11 
 
 		 196 aa  215  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  59.44 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  56.61 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  55.56 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  62.71 
 
 		 193 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  62.86 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  61.14 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  59.2 
 
 		 192 aa  188  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  53.97 
 
 		 197 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  51.72 
 
 		 183 aa  180  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  53.42 
 
 		 198 aa  177  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  49.23 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  50 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  48.72 
 
 		 188 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  48.89 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  51.18 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  51.18 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  50.59 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  50.84 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  47.28 
 
 		 186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.7 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  47.83 
 
 		 186 aa  158  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  44.79 
 
 		 183 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  43.68 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  44.44 
 
 		 185 aa  147  8e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  42.41 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  42.41 
 
 		 183 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.69 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  50 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  40 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  45.88 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  44.21 
 
 		 182 aa  141  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  42.78 
 
 		 186 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  44.97 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  44.13 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.78 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  40.88 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  38.1 
 
 		 180 aa  135  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  42.93 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.59 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  44.81 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  40.11 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  39.27 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  38.17 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  41.67 
 
 		 181 aa  134  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  38.34 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  35.45 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  35.45 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  35.45 
 
 		 180 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.67 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  40.45 
 
 		 188 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  41.11 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  47.44 
 
 		 208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  47.44 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  43.16 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  38.97 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  38.59 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  43.26 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  38.5 
 
 		 188 aa  124  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  40.44 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  43.03 
 
 		 208 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  39.69 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  41.71 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.37 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  42.58 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  39.77 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  35.75 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  38.95 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  41.04 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  37.79 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  43.56 
 
 		 208 aa  121  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  39.51 
 
 		 180 aa  121  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  38.46 
 
 		 194 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  42.94 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  41.52 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  39.18 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  39.55 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  42.94 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  39.01 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  40.36 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  41.04 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  38.59 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  39.88 
 
 		 196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  40.24 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  37.08 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  37.08 
 
 		 207 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  39.43 
 
 		 187 aa  117  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40.48 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  39.89 
 
 		 199 aa  117  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  41.24 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.26 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>