243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0344 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  47.88 
 
 
186 aa  169  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  52.07 
 
 
189 aa  167  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  52.26 
 
 
184 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.88 
 
 
183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.02 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  47.27 
 
 
183 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  45.56 
 
 
181 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  51.52 
 
 
188 aa  160  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  52.2 
 
 
188 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  46.93 
 
 
201 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  50.31 
 
 
183 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  45.81 
 
 
201 aa  158  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  50.3 
 
 
249 aa  157  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  52.56 
 
 
187 aa  156  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  51.92 
 
 
208 aa  155  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  46.06 
 
 
186 aa  154  7e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.06 
 
 
183 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  40.78 
 
 
183 aa  153  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  40.32 
 
 
184 aa  152  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.75 
 
 
186 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  53.33 
 
 
188 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.86 
 
 
184 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  42.16 
 
 
201 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  43.6 
 
 
192 aa  151  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  44.56 
 
 
197 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  46.29 
 
 
196 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  44.05 
 
 
184 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  44.51 
 
 
199 aa  148  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  39.88 
 
 
189 aa  147  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  41.86 
 
 
185 aa  147  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  40.4 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  41.34 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  45.4 
 
 
195 aa  144  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  41.62 
 
 
195 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40.21 
 
 
197 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  45.78 
 
 
195 aa  142  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  43.43 
 
 
194 aa  141  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  45.39 
 
 
189 aa  140  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  46.96 
 
 
193 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  43.03 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  41.82 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  43.64 
 
 
196 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  42.68 
 
 
184 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.42 
 
 
186 aa  136  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  47.13 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  41.92 
 
 
183 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  39.88 
 
 
184 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  40.61 
 
 
185 aa  135  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  42.53 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  47.13 
 
 
193 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  39.53 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  45.07 
 
 
181 aa  134  9e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  41.21 
 
 
202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  36.08 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  39.66 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  42.6 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  39.66 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  44.52 
 
 
186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  41.03 
 
 
185 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  39.66 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  37.16 
 
 
188 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  42.68 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  44 
 
 
185 aa  130  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  39.78 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  39.31 
 
 
180 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  35.71 
 
 
192 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  40.85 
 
 
194 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  45.22 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  40.7 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  40.94 
 
 
188 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  37.22 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  37.64 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  42.35 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  35.64 
 
 
193 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  38.42 
 
 
197 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  43.93 
 
 
192 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  42.44 
 
 
192 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  42.24 
 
 
182 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  37.02 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  37.27 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  37.65 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  38.07 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  38.07 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  34.85 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  38.27 
 
 
180 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.9 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  34.18 
 
 
210 aa  117  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  34.18 
 
 
210 aa  117  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  38.46 
 
 
212 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  35.71 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  35.29 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  35.75 
 
 
212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  38.04 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  36.16 
 
 
203 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  38.04 
 
 
187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  36.46 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  36.84 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  35.85 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  33.52 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>