247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0577 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  56.52 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  50.54 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  49.46 
 
 		 183 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  53.18 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  52.07 
 
 		 249 aa  180  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  50 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  48.26 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  49.71 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  47.7 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  45.36 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  45.36 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  45.36 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  44.26 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.55 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  48.8 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  45.09 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  43.17 
 
 		 180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  51.81 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  45.2 
 
 		 187 aa  158  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  47.59 
 
 		 186 aa  157  6e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  47.56 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  44.38 
 
 		 185 aa  157  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  45.81 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  41.4 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  44.32 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  42.2 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  46.15 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  45.66 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  43.93 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  46.01 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  42.94 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  44.77 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.44 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  41.04 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  43.56 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  42.17 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  42.2 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  45.4 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  44.79 
 
 		 208 aa  140  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  44.83 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  37.5 
 
 		 195 aa  140  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  41.67 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  43.09 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.44 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.01 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  43.56 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.49 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  44.74 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  43.27 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  40.96 
 
 		 189 aa  136  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  41.52 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  39.04 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  43.43 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  44.97 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.07 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  46.1 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  41.44 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  38.2 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  40.83 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  38.8 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  39.89 
 
 		 193 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.69 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  41.21 
 
 		 190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  39.2 
 
 		 196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  40.38 
 
 		 191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  40.96 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  38.2 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  41.38 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  37.89 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  40.49 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  35.8 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.1 
 
 		 217 aa  121  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  38.59 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  40.34 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  40 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  39.01 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  37.84 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  36.84 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  39.74 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  42.69 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0331  hypothetical protein  39.15 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  38.32 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  42.01 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  42.01 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  39.08 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  38.42 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  40.43 
 
 		 218 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  37.63 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  37.78 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  34.44 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  34.88 
 
 		 185 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  32.77 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  37.36 
 
 		 196 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  40.24 
 
 		 220 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  37.8 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  36.53 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0102  hypothetical protein  39.18 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.95764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>