241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1437 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  51.06 
 
 
195 aa  191  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  51.14 
 
 
196 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  55.83 
 
 
195 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  45.69 
 
 
197 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  49.7 
 
 
197 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  47.8 
 
 
201 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  50.56 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  50.3 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  48.88 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  45.99 
 
 
198 aa  170  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  49.15 
 
 
196 aa  167  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  51.63 
 
 
195 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  48.86 
 
 
188 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  51.61 
 
 
196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  52.87 
 
 
188 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  49.43 
 
 
199 aa  157  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  51.88 
 
 
188 aa  157  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  50 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  51.52 
 
 
192 aa  151  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  50.87 
 
 
193 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  50.29 
 
 
193 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.67 
 
 
183 aa  141  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  40.35 
 
 
183 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  40.35 
 
 
183 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  41.76 
 
 
185 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.94 
 
 
183 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  40.94 
 
 
183 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  43.79 
 
 
186 aa  131  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  38.74 
 
 
186 aa  130  9e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  43.23 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  38.15 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  38.6 
 
 
183 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  40.72 
 
 
186 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  44.94 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.41 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42.95 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  33.85 
 
 
197 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  40.12 
 
 
183 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  41.14 
 
 
186 aa  125  3e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  35.79 
 
 
207 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  35.79 
 
 
207 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  43.4 
 
 
185 aa  123  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  34.54 
 
 
188 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.73 
 
 
181 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  38.64 
 
 
192 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40.76 
 
 
182 aa  121  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  38.37 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  37.8 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  35.86 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  40.37 
 
 
185 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  37.63 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  40.45 
 
 
192 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  37.79 
 
 
217 aa  119  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  40 
 
 
193 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  40.88 
 
 
249 aa  118  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  35.57 
 
 
212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  40.26 
 
 
186 aa  117  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  40 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  37.16 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  37.08 
 
 
185 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  42.14 
 
 
189 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  40.96 
 
 
182 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  35.38 
 
 
185 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  38.36 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  37.85 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  38.36 
 
 
211 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  35.47 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  39.2 
 
 
208 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  38.99 
 
 
211 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  36.67 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  36.87 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  36.79 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  37.78 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  39.66 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  35.68 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  37.5 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  38.64 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  37.27 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  35.14 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  35.6 
 
 
208 aa  112  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  41.18 
 
 
187 aa  112  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  35.11 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  36.78 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  36.11 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  36.32 
 
 
187 aa  111  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  37.5 
 
 
190 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  35.71 
 
 
208 aa  111  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  37.29 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  40.7 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  40.7 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  32.32 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  34.97 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  34.2 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  36.32 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  36.32 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  37.08 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  35.11 
 
 
208 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>