242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000294 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  100 
 
 		 196 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  67.96 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  60.91 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  59.56 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  55.1 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  58.47 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  60 
 
 		 195 aa  211  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  58.29 
 
 		 195 aa  207  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  53.93 
 
 		 196 aa  206  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  57.61 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  50.51 
 
 		 195 aa  204  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  58.66 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  48.96 
 
 		 197 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  51.04 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  59.87 
 
 		 193 aa  177  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  60.53 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  49.15 
 
 		 198 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.69 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  54.55 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  54.94 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.42 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  43.75 
 
 		 183 aa  161  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.07 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  43.23 
 
 		 183 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  45.41 
 
 		 186 aa  157  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  43.15 
 
 		 183 aa  157  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  42.71 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  48.33 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.37 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.35 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  47.46 
 
 		 184 aa  154  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  43.08 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  42.86 
 
 		 186 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  43.82 
 
 		 186 aa  148  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  46.86 
 
 		 183 aa  147  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  46.67 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  41.99 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  40.82 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  42.22 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  39.27 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  38.78 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  39.9 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  38.66 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.58 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  43.4 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  40.61 
 
 		 212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  39.78 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  38.66 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  44.44 
 
 		 192 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  39.89 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  42.29 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.78 
 
 		 181 aa  133  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  41.54 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  43.12 
 
 		 186 aa  132  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  41.71 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  41.71 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  41.11 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  40.83 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  38.86 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  38.12 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  40 
 
 		 180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  42.7 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  38.33 
 
 		 184 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  38.86 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  41.9 
 
 		 196 aa  127  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  42.7 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  38.86 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  37.7 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  39.43 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  37.78 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  37.37 
 
 		 201 aa  125  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  39.69 
 
 		 217 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  38.62 
 
 		 195 aa  124  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  38.14 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  35.2 
 
 		 212 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  41.67 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  38.92 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  38.38 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  38 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  38.54 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  42.31 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  33.67 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  42.31 
 
 		 215 aa  122  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  38.29 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  34.78 
 
 		 189 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  38.25 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  37.89 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  34.18 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  38.86 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  34.74 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  36 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  38.92 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  38.86 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  34.18 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  35.43 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  35.11 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  35.43 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  35.43 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  35.43 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  35.43 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>