244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1528 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  70.86 
 
 		 195 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  64.4 
 
 		 196 aa  248  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  68 
 
 		 195 aa  241  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  66.48 
 
 		 201 aa  241  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  68.13 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  65.75 
 
 		 199 aa  230  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  62.29 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  54.92 
 
 		 198 aa  220  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  55.1 
 
 		 195 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  62.22 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  66.85 
 
 		 193 aa  214  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  58.43 
 
 		 196 aa  214  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  54.4 
 
 		 197 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  67.05 
 
 		 193 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  55.61 
 
 		 188 aa  204  6e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  65.34 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  57.63 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  53.12 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  57.63 
 
 		 188 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  51.56 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  56.25 
 
 		 192 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  48.19 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  46.11 
 
 		 181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  43.98 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.63 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  50.85 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  48.47 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  53.46 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  45.6 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  44.33 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  43.75 
 
 		 184 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  44.85 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.33 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  50.96 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  48.88 
 
 		 182 aa  162  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.69 
 
 		 186 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  50.57 
 
 		 186 aa  157  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.33 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  48.88 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  43.65 
 
 		 192 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  46.89 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  46.63 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  46.11 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  44.04 
 
 		 182 aa  150  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  46.29 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  43.96 
 
 		 185 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  47.75 
 
 		 192 aa  147  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  47.19 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  42.86 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  43.75 
 
 		 180 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  42.19 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  42.19 
 
 		 180 aa  145  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  48.5 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  43.17 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  41.67 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  41.67 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  41.53 
 
 		 191 aa  140  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  42.7 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  40 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  44.94 
 
 		 181 aa  140  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  44.79 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  45.14 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  37.37 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  41.15 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  43.02 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  44.97 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  40.72 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  44.57 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  44.25 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  41.27 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  42.27 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  41.27 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  38.17 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  46.02 
 
 		 202 aa  136  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  43.48 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  40.34 
 
 		 188 aa  136  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  40 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  44 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  40.31 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  42.41 
 
 		 208 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  43.26 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  42.56 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  42.78 
 
 		 187 aa  134  8e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  40.74 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  39.18 
 
 		 217 aa  133  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  38.95 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  40.32 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  39.29 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  38.78 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  38.46 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  40.5 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  40 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  41.71 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  37.69 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  42.05 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  38.86 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  39.69 
 
 		 215 aa  128  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  38.14 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  38 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>