245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1210 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  100 
 
 
187 aa  383  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  53.23 
 
 
187 aa  202  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  51.1 
 
 
185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  51.89 
 
 
186 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  47.8 
 
 
184 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.85 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  49.73 
 
 
186 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  47.31 
 
 
183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.74 
 
 
183 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  44.02 
 
 
183 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  44.57 
 
 
188 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  45.96 
 
 
188 aa  150  8e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.21 
 
 
183 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  41.07 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.6 
 
 
181 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  41.71 
 
 
198 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  42.77 
 
 
185 aa  141  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  45.51 
 
 
192 aa  141  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  41.76 
 
 
182 aa  140  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  39.77 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  42.42 
 
 
180 aa  138  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.26 
 
 
188 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  36.7 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  37.1 
 
 
184 aa  137  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  37.65 
 
 
184 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  39.18 
 
 
180 aa  134  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  38.6 
 
 
180 aa  134  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  38.6 
 
 
180 aa  134  9e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  38.6 
 
 
180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  39.2 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  41.56 
 
 
187 aa  132  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42.69 
 
 
184 aa  131  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  35.05 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  43.75 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  36.36 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  42.61 
 
 
196 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  38.62 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  39.39 
 
 
183 aa  127  7.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  35.83 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  38.95 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  39.64 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  36.96 
 
 
185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  40.12 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  39.64 
 
 
191 aa  124  5e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  37.84 
 
 
201 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  41.36 
 
 
192 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  44.3 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  41.32 
 
 
188 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  41.29 
 
 
187 aa  123  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  38.1 
 
 
199 aa  122  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  39.52 
 
 
187 aa  122  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  36.55 
 
 
195 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  38.38 
 
 
201 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  36.47 
 
 
185 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  39.11 
 
 
185 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.5 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  34.41 
 
 
188 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  34.41 
 
 
188 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  34.41 
 
 
188 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  38.92 
 
 
196 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  36.7 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  38.12 
 
 
187 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  37.21 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  31.55 
 
 
184 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  38.85 
 
 
249 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  39.49 
 
 
186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  31.55 
 
 
189 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  38.07 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  33.67 
 
 
197 aa  115  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  115  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  31.07 
 
 
189 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  33.7 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  37.79 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  37.43 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  37.78 
 
 
195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  37.08 
 
 
196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  33.91 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  34.07 
 
 
189 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  35.15 
 
 
186 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  34.3 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  37.14 
 
 
185 aa  111  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  36.63 
 
 
197 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  32.26 
 
 
188 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  32.26 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  39.33 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  31.25 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  32.26 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  32.99 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  33.33 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  38.32 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  30.85 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  32.93 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  36.65 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  35.43 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  37.72 
 
 
208 aa  108  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  39.41 
 
 
187 aa  108  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  33.72 
 
 
189 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  35.57 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  43.26 
 
 
194 aa  107  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  36.84 
 
 
211 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>