248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1740 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  93.53 
 
 		 201 aa  362  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  63.16 
 
 		 196 aa  252  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  70.11 
 
 		 195 aa  251  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  70.69 
 
 		 195 aa  247  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  70.86 
 
 		 196 aa  244  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  65.38 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  59.9 
 
 		 194 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  58.55 
 
 		 198 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  66.11 
 
 		 199 aa  228  7e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  58.89 
 
 		 196 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  54.45 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  53.85 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  64.04 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  64.94 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  53.81 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  63.22 
 
 		 193 aa  195  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  55 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  52.08 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  61.49 
 
 		 192 aa  190  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  51.83 
 
 		 183 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  47.09 
 
 		 183 aa  184  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  55.75 
 
 		 188 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  47.15 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  52.17 
 
 		 198 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  46.39 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.88 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  50.26 
 
 		 183 aa  171  7.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  44.74 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  46.11 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  45.36 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  45.31 
 
 		 184 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.56 
 
 		 186 aa  167  9e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  48.3 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  49.13 
 
 		 184 aa  165  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  49.72 
 
 		 249 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  43.65 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  50.31 
 
 		 185 aa  162  4.0000000000000004e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.32 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  45.26 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  41.36 
 
 		 181 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  44.74 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  47.13 
 
 		 186 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  49.44 
 
 		 192 aa  157  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  42.93 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  45.81 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  46.59 
 
 		 186 aa  154  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  44.89 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  47.74 
 
 		 189 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  41.84 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  45.55 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  40.21 
 
 		 193 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  40.33 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.85 
 
 		 196 aa  142  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  42.02 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  41.86 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  38.95 
 
 		 182 aa  141  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  40.66 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  40.2 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  41.62 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  40 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  38.86 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  41.94 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  41.94 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  43.86 
 
 		 190 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  43.93 
 
 		 208 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  40.46 
 
 		 189 aa  137  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  41.24 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  42.62 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  43.35 
 
 		 187 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  40.78 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  40.8 
 
 		 187 aa  135  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  43.09 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  40.86 
 
 		 190 aa  134  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  40.68 
 
 		 196 aa  133  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  38.95 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  39.29 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  38.95 
 
 		 180 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  39.15 
 
 		 208 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  38.74 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  40.57 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  35.23 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  38.89 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  38.42 
 
 		 180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  40.68 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  38.74 
 
 		 193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  40.2 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  39.77 
 
 		 187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  45.81 
 
 		 192 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  46.1 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  37.91 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  39.7 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  39.11 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  39.7 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  32.64 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  35.38 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  40.96 
 
 		 208 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  41.4 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  41.4 
 
 		 193 aa  124  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  40.78 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>