242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2020 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  100 
 
 		 211 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  99.53 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  95.26 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  73.93 
 
 		 211 aa  332  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  79.9 
 
 		 246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  77.61 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  67.35 
 
 		 208 aa  264  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  73.03 
 
 		 202 aa  261  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  65.46 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  63.37 
 
 		 215 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  57.69 
 
 		 207 aa  237  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  64.95 
 
 		 210 aa  236  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  60.51 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  60.51 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  58.82 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  64.17 
 
 		 204 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  58.76 
 
 		 197 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  60.75 
 
 		 214 aa  220  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  50 
 
 		 214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  51.05 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  58.24 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  55.67 
 
 		 194 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  52.79 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  52.38 
 
 		 197 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1074  LemA family protein  53.09 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  51.31 
 
 		 207 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  51.31 
 
 		 207 aa  194  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  54.95 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  52.06 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  54.59 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  55.19 
 
 		 197 aa  192  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  54.35 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  51.74 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  54.82 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  55.43 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0102  hypothetical protein  56.74 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.95764  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  53.97 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  54.75 
 
 		 194 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  50.26 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0331  hypothetical protein  57.31 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  54.5 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  48.98 
 
 		 194 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  52.04 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  52.04 
 
 		 201 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  54.19 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0879  hypothetical protein  53.55 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  51.58 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  54.75 
 
 		 193 aa  185  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  54.19 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  54.19 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  57.37 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  54.19 
 
 		 193 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  52.85 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  49.24 
 
 		 194 aa  184  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  52.51 
 
 		 193 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  50 
 
 		 210 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0145  LemA protein  55.87 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  49.22 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  49.49 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0991  hypothetical protein  52.85 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  52.81 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2694  LemA family protein  55.06 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4853  LemA family protein  54.49 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  47.26 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1511  LemA family protein  60.65 
 
 		 204 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0259  LemA family protein  60 
 
 		 199 aa  181  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  52.81 
 
 		 194 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  49.22 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  50.78 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  53.8 
 
 		 200 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0381  LemA family protein  54.19 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  52.22 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  52.22 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  51.67 
 
 		 210 aa  178  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  51.12 
 
 		 196 aa  178  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  49.49 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0867  hypothetical protein  54.07 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  51.11 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  49.74 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  50.56 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  49.25 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  47.96 
 
 		 198 aa  174  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  53.07 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0664  lipoprotein  55.56 
 
 		 199 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.742041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  45.92 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  52.54 
 
 		 199 aa  171  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  47.76 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  46.32 
 
 		 195 aa  171  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  48.22 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  46.84 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  50.28 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  49.72 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  48.39 
 
 		 192 aa  168  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0413  LemA family protein  50.54 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  45.23 
 
 		 192 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>