238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1518 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1518  LemA  100 
 
 
215 aa  439  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  72.16 
 
 
193 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  72.16 
 
 
193 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  47.5 
 
 
188 aa  148  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.32 
 
 
188 aa  137  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  48.3 
 
 
188 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  43.24 
 
 
195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  44.87 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  41.86 
 
 
198 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  44.52 
 
 
201 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  42.31 
 
 
196 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  37.82 
 
 
196 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  42.95 
 
 
196 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  41.71 
 
 
183 aa  121  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  45.39 
 
 
195 aa  121  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.67 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  39.38 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  37.71 
 
 
195 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  39.44 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  38.37 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  37.95 
 
 
197 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  41.61 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  38.61 
 
 
187 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  109  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  42.33 
 
 
193 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  37.82 
 
 
186 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.1 
 
 
185 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  38.61 
 
 
185 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  36.81 
 
 
181 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  38.18 
 
 
183 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  36.71 
 
 
183 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  42.5 
 
 
193 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  41.61 
 
 
193 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  41.84 
 
 
186 aa  104  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  38.75 
 
 
183 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  40.12 
 
 
184 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  37.58 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  36.53 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  40.34 
 
 
187 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  38 
 
 
187 aa  102  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  38.12 
 
 
183 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  35.48 
 
 
184 aa  99  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  34.15 
 
 
186 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  35.06 
 
 
184 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  35.37 
 
 
185 aa  98.6  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  40.13 
 
 
192 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  34.15 
 
 
186 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  37.59 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.09 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  32.91 
 
 
190 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  36.08 
 
 
188 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  38.1 
 
 
185 aa  96.3  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  31.32 
 
 
189 aa  95.1  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  34.55 
 
 
191 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  37.5 
 
 
189 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  32.7 
 
 
192 aa  92  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  34.87 
 
 
181 aa  92.4  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  33.13 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  31.9 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  32.12 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  29.59 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  35.26 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  35.77 
 
 
190 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  33.73 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  33.75 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  36.81 
 
 
185 aa  89  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  34.55 
 
 
198 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  33.99 
 
 
186 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  34.16 
 
 
195 aa  89  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  31.64 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  32.88 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  31.79 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  32.43 
 
 
249 aa  86.3  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  35.67 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  35.14 
 
 
184 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  37.31 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  33.99 
 
 
185 aa  85.5  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  29.71 
 
 
201 aa  85.1  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  31.76 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  31.21 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  33.33 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  32.91 
 
 
190 aa  84  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  33.33 
 
 
187 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  35.53 
 
 
182 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  32.89 
 
 
189 aa  82  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  26.7 
 
 
202 aa  82  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  30.82 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  32.37 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  31.43 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  33.12 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  31.21 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  33.13 
 
 
202 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  79  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  31.68 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  30.39 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  30.21 
 
 
211 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  31.03 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  29.45 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>