238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0428 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  72.16 
 
 
215 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  72.16 
 
 
192 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  40.11 
 
 
198 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.46 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  39.33 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  40.23 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  42.18 
 
 
188 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  40.24 
 
 
199 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  40.36 
 
 
188 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  41.56 
 
 
195 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  40.51 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  36.13 
 
 
197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  40.51 
 
 
201 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  37.36 
 
 
196 aa  118  6e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  42.76 
 
 
195 aa  117  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  40.88 
 
 
183 aa  117  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  39.16 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  41.5 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  38.1 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  39.87 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  38.51 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  42.36 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  36.18 
 
 
194 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  35.08 
 
 
183 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  36.3 
 
 
184 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  34.21 
 
 
183 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  38.46 
 
 
183 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  38.04 
 
 
183 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  39.51 
 
 
193 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  37.36 
 
 
182 aa  102  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  38.65 
 
 
183 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  34.21 
 
 
183 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  38.29 
 
 
187 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  41.55 
 
 
185 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  36.25 
 
 
183 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  35.56 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  31.9 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  39.38 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  33.77 
 
 
198 aa  99  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  40 
 
 
193 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  33.7 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  36.5 
 
 
186 aa  98.6  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  36.88 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  32.79 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1707  LemA family protein  38.31 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  35.56 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  36.11 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  30.36 
 
 
187 aa  95.5  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  32.89 
 
 
249 aa  95.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  35.26 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  31.52 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  35.15 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  33.11 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  37.59 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  32.5 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  34.13 
 
 
184 aa  92  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  33.33 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  31.18 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  29.48 
 
 
184 aa  88.6  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  32.1 
 
 
201 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  32.89 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  30.3 
 
 
191 aa  87  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  34.23 
 
 
184 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  33.97 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  31.54 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  34.9 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  34 
 
 
192 aa  85.9  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  30.54 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3965  LemA family protein  39.53 
 
 
187 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  32.7 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  30.59 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  27.37 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  35.88 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  34.36 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  30.06 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  31.41 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  30.2 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.72 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  32.1 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  30.23 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  29.48 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  29.81 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  28.65 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  34.04 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  31.1 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  27.52 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  33.33 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  34.03 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  34.03 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  29.76 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  29.24 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04770  hypothetical protein  30.05 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158149  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  31.58 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0261  LemA family protein  29.81 
 
 
434 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313528  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  32.31 
 
 
437 aa  75.5  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  27.38 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3731  LemA family protein  31.34 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0304195 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  27.78 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>