243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2286 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  56.89 
 
 		 187 aa  194  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  52.17 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  56.8 
 
 		 187 aa  191  6e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  54.71 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  48.09 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  46.34 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  44.57 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  42.77 
 
 		 187 aa  141  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.62 
 
 		 188 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  43.67 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1882  LemA family protein  41.92 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  41.44 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  39.88 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  39.88 
 
 		 201 aa  127  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  39.33 
 
 		 181 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  41.21 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  39.29 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  39.53 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  38.86 
 
 		 187 aa  124  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  38.95 
 
 		 186 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  42.67 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  36.31 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  39.33 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  35.06 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  44.29 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3652  LemA family protein  36.42 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4662  hypothetical protein  35.11 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  36.31 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  40.79 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.3 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  36.78 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  37.21 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  38.42 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  34.97 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  34.62 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  37.95 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  36.69 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  38.82 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  38.95 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4056  LemA family protein  33.86 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  38.15 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3832  LemA family protein  34.41 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3925  LemA family protein  34.41 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  37.13 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4041  LemA family protein  34.41 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  35.63 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  36.21 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  36.69 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  37.29 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4246  LemA family protein  34.78 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4207  LemA family protein  34.78 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  36.09 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  36.02 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4380  LemA family protein  34.97 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  37.41 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  36.36 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  37.5 
 
 		 249 aa  110  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  36.75 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3560  hypothetical protein  35.88 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  41.56 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  37.91 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  41.56 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0157  LemA family protein  35.88 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  37.89 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  41.22 
 
 		 196 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  33.16 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  40.91 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  34.97 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0137  LemA family protein  38.56 
 
 		 189 aa  108  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  37.21 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  40.98 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  39.6 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  37.06 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  36.05 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  38.27 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  35.11 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  36.05 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  36.63 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  36.47 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  36.31 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  35.29 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  35.9 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  37.85 
 
 		 195 aa  104  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  39.6 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  37.2 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  40 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  38.98 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  38.78 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  38.06 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  35.93 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  38.99 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  36.97 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  39.62 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  39.62 
 
 		 194 aa  100  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  39.47 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  37.5 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  35.39 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>