242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2430 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2430  LemA family protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.148437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  37.85 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  38.69 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  35.39 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  35.93 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  35.33 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  36.42 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  33.15 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  33.53 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  42.36 
 
 		 184 aa  114  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  39.88 
 
 		 201 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  37.16 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  36.56 
 
 		 183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  36.46 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  34.73 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  33.33 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  39.74 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0120  LemA family protein  34.73 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000229196  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  34.64 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  37.75 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  32.75 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  38.24 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  35.06 
 
 		 249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  36.14 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  36.88 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  39.16 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  33.89 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  35.85 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  32.04 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  35.85 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  37.65 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  36.36 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  36.55 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  34.69 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  29.51 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  35.58 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  37.18 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  36.54 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  32.14 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  35.4 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  31.55 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  30 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  32.37 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  32.39 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  32.6 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  34.15 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  33.51 
 
 		 182 aa  98.2  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  32.6 
 
 		 180 aa  98.6  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  33.9 
 
 		 196 aa  97.8  8e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  33.71 
 
 		 197 aa  97.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  31.02 
 
 		 193 aa  97.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  30.81 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  33.52 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  33.72 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  32.37 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  33.72 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  32.04 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  30.64 
 
 		 217 aa  95.9  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  31.55 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  29.89 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  33.54 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  35.37 
 
 		 191 aa  93.6  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  33.14 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  31.64 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  29.34 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  30.41 
 
 		 182 aa  92.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  31.82 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  32.92 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  36.6 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  35.71 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  31.93 
 
 		 196 aa  91.7  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  32.3 
 
 		 185 aa  90.9  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  35.76 
 
 		 195 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  35.1 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  33.56 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  33.57 
 
 		 194 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  34.27 
 
 		 194 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  27.6 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  33.33 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  32.93 
 
 		 188 aa  87.4  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  34.27 
 
 		 194 aa  87.4  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0452  hypothetical protein  34.23 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0428  hypothetical protein  34.23 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  35.46 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  33.14 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0659  LemA family protein  35.71 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1518  LemA  35.71 
 
 		 215 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.639052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  31.55 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  29.01 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  33.57 
 
 		 194 aa  85.1  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  31.65 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  32.19 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  35.33 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  34.92 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  36.64 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  29.44 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  30.3 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1702  LemA protein  32 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.159811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>